Les Sith n'avaient désormais plus de leader. Darth Malak était mort lors de son dernier duel contre Darth Revan, revenu vers le Côté Lumineux de la Force. La flotte de l'Empire Sith avait été totalement annihilée lors de la Bataille de la Forge Stellaire et les quelques vaisseaux qui étaient parvenus à s'enfuir étaient gravement endommagés. Sur Korriban, au sein même de l'Académie Sith, suite à la mort d'Uthar Wynn, un combat sans égal opposait aussi bien les Seigneurs Sith que Apprentis Sith pour l'obtention de la direction de l'Académie. Ce conflit ravagea totalement l'intérieur du bâtiment. Les Sith s'entretuèrent et, bientôt, Korriban tomba dans l'oubli. Mais trois Seigneurs Noirs, Darth Nihilus, Darth Sion et Darth Traya, parvinrent à survivre et à rallier Malachor V, planète sur laquelle se trouvait l'Académie Trayus. Ils firent le voeu d'anéantir à jamais les Jedi, période que l'histoire galactique retient sous le nom de Première Purge des Jedi.